El SAQ disposa de 4 espectròmetres de masses:
- ICP-MS: espectròmetre de masses de plasma acoblat inductivament 7500 ce, Agilent Technologies.
- GC-MS: cromatògraf de gasos 6890, Agilent Technologies - espectròmetre de masses 5973, Hewlett-Packard.
- LC-MS: cromatògraf líquid 1100, Agilent Technologies - espectròmetre de masses de trampa d'ions Amazon, Bruker Daltonics.
- LC-MS: cromatògraf líquid 1200 RR, Agilent Technologies - espectròmetre de masses de quadrupol - temps de vol (QTOF) microTOF-Q, Bruker Daltoniks.
