El SeRMN pone a la disposición de sus usuarios diferentes ordenadores equipados con el siguiente software: TOPSPIN para la adquisición y procesado de espectros, PARAVISION para la adquisición y procesamiento de imagénes de RMN, DATA ANALYSYS para la adquisición y procesado de espectros de masas y cromatogramas HPLC, AMIX como base de datos de espectros especializada en metabonómica, PERCH para la predicción espectral y SIMCA para el análisis estadístico.